Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
MKRN3Q13064 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
MKRN3Q13064 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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