Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SKIDA1Q1XH10 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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