Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CLPPQ16740 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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