Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TRIP10Q15642 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TRIP10Q15642 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms