Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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