Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CAPRIN1Q14444 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms