Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TUBA3CQ13748 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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