Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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