Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RESTQ13127 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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RESTQ13127 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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RESTQ13127 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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RESTQ13127 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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RESTQ13127 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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