Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CHAF1BQ13112 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHAF1BQ13112 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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