Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF3C1Q12789 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
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GTF3C1Q12789 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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