Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SPOCK3Q9BQ16 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms