Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP53Q70EK8 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP53Q70EK8 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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