Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SAMD1Q6SPF0 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SAMD1Q6SPF0 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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