Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SMAD4Q13485 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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