Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MKRN4PQ13434 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms