Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPREP23469 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPREP23469 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPREP23469 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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