Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VGFO15240 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VGFO15240 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VGFO15240 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VGFO15240 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
VGFO15240 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
VGFO15240 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms