Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
NISCHQ9Y2I1 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NISCHQ9Y2I1 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.9 ms