Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TPRNQ4KMQ1 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
TPRNQ4KMQ1 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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