Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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SGCBQ16585 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SGCBQ16585 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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