Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CARTPTQ16568 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CARTPTQ16568 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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