Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
RESTQ13127 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RESTQ13127 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RESTQ13127 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms