Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HOXD9P28356 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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