Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPREP23469 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPREP23469 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPREP23469 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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