Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1Q9UJ41 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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