Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
COPS7AQ9UBW8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
COPS7AQ9UBW8 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 285.8 ms