Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RBM42Q9BTD8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RBM42Q9BTD8 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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