Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NCF4Q15080 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NCF4Q15080 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms