Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NFIAQ12857 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
NFIAQ12857 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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