Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRBP23467 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms