Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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RABGEF1Q9UJ41 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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