Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
C1orf140Q5VVS0 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms