Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TAF1AQ15573 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.72□□□□□ -2.29
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