Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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NAE1Q13564 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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NAE1Q13564 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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NAE1Q13564 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NAE1Q13564 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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NAE1Q13564 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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NAE1Q13564 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NAE1Q13564 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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