Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LSAMPQ13449 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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