Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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TRAF3Q13114 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TRAF3Q13114 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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