Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFX1Q12986 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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