Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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PTPRBP23467 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRBP23467 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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