Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
MSH5O43196 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MSH5O43196 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MSH5O43196 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MSH5O43196 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
MSH5O43196 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
MSH5O43196 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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