Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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CNGA3Q16281 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGA3Q16281 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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