Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NPTX1Q15818 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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