Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CAMK2BQ13554 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CAMK2BQ13554 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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