Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
DUSP4Q13115 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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