Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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NFIAQ12857 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NFIAQ12857 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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