Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SGCAQ16586 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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SGCAQ16586 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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SGCAQ16586 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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SGCAQ16586 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SGCAQ16586 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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