Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NKX1-1Q15270 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NKX1-1Q15270 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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