Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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