Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RPA4Q13156 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms