| RPA4 | Q13156 | AC068790.2-201 | ENST00000602601 | 557 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | C8orf59-207 | ENST00000611854 | 563 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MALAT1-207 | ENST00000613376 | 132 nt | TSL 3 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC009161.2-201 | ENST00000624626 | 138 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND5P6-201 | ENST00000422338 | 1798 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | RICTOR-202 | ENST00000357387 | 9543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC008555.8-201 | ENST00000623602 | 2168 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | OR5H15-201 | ENST00000383696 | 930 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-611P-201 | ENST00000384276 | 104 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR518A2-201 | ENST00000384966 | 87 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1245P-201 | ENST00000411130 | 106 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL356379.1-201 | ENST00000414105 | 126 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | WARS2P1-201 | ENST00000429678 | 537 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL031659.1-201 | ENST00000447075 | 539 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND1P18-201 | ENST00000448191 | 573 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | GMFBP1-201 | ENST00000467831 | 427 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC006512.1-201 | ENST00000468816 | 291 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL139147.1-201 | ENST00000502413 | 1156 nt | TSL 2 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND2P33-201 | ENST00000506452 | 1031 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC008549.1-201 | ENST00000512900 | 643 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC097467.1-201 | ENST00000513660 | 370 nt | TSL 5 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC117532.1-201 | ENST00000514638 | 323 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC022616.8-201 | ENST00000533569 | 253 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | LINC01493-203 | ENST00000534756 | 509 nt | TSL 3 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC078814.3-201 | ENST00000553036 | 491 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR4703-201 | ENST00000577728 | 79 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC007631.1-201 | ENST00000578545 | 189 nt | TSL 3 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR4287-201 | ENST00000579398 | 78 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | Z82243.1-201 | ENST00000609432 | 473 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL162373.1-201 | ENST00000620433 | 407 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | SDR42E1P4-201 | ENST00000620894 | 481 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | VPS54-202 | ENST00000354504 | 3594 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | XRCC4-205 | ENST00000511817 | 1636 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | ZNF658B-202 | ENST00000615961 | 3375 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | MDM2-206 | ENST00000350057 | 1401 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL390237.1-201 | ENST00000404226 | 1415 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| RPA4 | Q13156 | OR6C76-201 | ENST00000328314 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | COMMD6-201 | ENST00000355801 | 486 nt | TSL 2 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-606P-201 | ENST00000384721 | 111 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | BCL2L15-203 | ENST00000393320 | 276 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL512604.1-201 | ENST00000404812 | 257 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORA3.2-201 | ENST00000408221 | 125 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | U3.40-201 | ENST00000408706 | 208 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC083867.1-201 | ENST00000413567 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC003985.1-201 | ENST00000414127 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | DNAJC19P4-201 | ENST00000440115 | 345 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | SPIN4-AS1-201 | ENST00000451979 | 426 nt | TSL 2 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL353752.1-201 | ENST00000454946 | 260 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC079140.5-201 | ENST00000507882 | 310 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC106744.2-201 | ENST00000513955 | 898 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | SCARNA16.3-201 | ENST00000516595 | 184 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | IGHVIII-5-1-201 | ENST00000523059 | 99 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AP001893.2-201 | ENST00000526949 | 202 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | CYCSP27-201 | ENST00000527643 | 293 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC018630.3-201 | ENST00000542637 | 96 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC040904.1-201 | ENST00000590850 | 223 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL590229.1-201 | ENST00000603497 | 542 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC121247.2-201 | ENST00000604776 | 136 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR6873-201 | ENST00000622788 | 63 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | KLRA1P-202 | ENST00000510134 | 1410 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | ZNF720P1-201 | ENST00000562403 | 1939 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC069228.1-201 | ENST00000546936 | 1615 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIRLET7G-201 | ENST00000362280 | 84 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | snoU2_19.1-201 | ENST00000362361 | 80 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1222P-201 | ENST00000384615 | 107 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR29C-201 | ENST00000385231 | 88 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU2-48P-201 | ENST00000410694 | 191 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RN7SKP142-201 | ENST00000411236 | 328 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | Z98742.3-201 | ENST00000418637 | 326 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL162400.2-201 | ENST00000427547 | 157 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC245102.2-201 | ENST00000448956 | 180 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC016751.1-201 | ENST00000458254 | 306 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNA5SP233-201 | ENST00000459153 | 113 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC106892.1-201 | ENST00000491608 | 406 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-377P-201 | ENST00000515965 | 102 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC109479.2-201 | ENST00000517842 | 174 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC022695.3-201 | ENST00000523385 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | CPSF6-207 | ENST00000551516 | 234 nt | TSL 2 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC091544.4-201 | ENST00000555268 | 342 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR3913-1-201 | ENST00000577744 | 102 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL589765.7-201 | ENST00000601684 | 629 nt | TSL 3 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC073114.1-201 | ENST00000612027 | 490 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC099842.1-201 | ENST00000619919 | 596 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNX16-212 | ENST00000615066 | 1918 nt | TSL 5 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC092881.1-201 | ENST00000638218 | 2733 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | CEP57L1-223 | ENST00000523787 | 2522 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-37P-201 | ENST00000362692 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-105P-201 | ENST00000363909 | 104 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-11P-201 | ENST00000364234 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-25P-201 | ENST00000383873 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1-201 | ENST00000383898 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-48P-201 | ENST00000384161 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-36P-201 | ENST00000384172 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-4P-201 | ENST00000384205 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-5P-201 | ENST00000384238 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-3P-201 | ENST00000384314 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.480-201 | ENST00000384364 | 102 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-434P-201 | ENST00000384376 | 107 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |