Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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